GMP微生物实验室设计的基本思路是经济实用。净化要求等级为1万级。实验室设计有实验前的准备工作，如一级、二级、风淋、缓冲等。采用人流物流分离原则，减少实验污染，确保安全。
A、这种布局紧凑合理，满足了实验室操作和空气清洁度的要求，同时坚持科学经济的原则，考虑到实验室的最佳要求、发展和运营成本。
B、在洁净室入口处设置淋浴房，可以有效清除人体内的灰尘，减少洁净室内的灰尘量。同时，淋浴房也起到了气闸的作用，防止不洁空气从门进入洁净区。
C、洁净室需要向室内提供一定比例的新鲜空气，净化过滤后进入各个实验室进行补偿排气，保证正压和工作人员的需要。
D、风量回风次数采用风量调节阀控制不同要求清洁水平的区域，调节压力梯度，确保气流与“清洁”区域流向“污染”区域，洁净室不同水平之间的压差为≥洁净室与室外压差为5pa≥10pa。
E、洁净室配有紫处灯灭菌装置。
F、传送窗口采用全不锈钢材料，机械联锁控制，内置灭菌装置。
G、观察窗为密闭洁净窗，门为气密洁净门。
微生物学实验室的基本要求：
(1)准备室准备室用于准备培养基和样品处理。室内有专柜、实验台、电炉、冰箱、上下水道、电源等。有试剂柜、存放器具或材料。
(二)洗涤室用于洗涤器皿等。因为用过的器皿已经被微生物污染，有时还会有病原微生物。因此，如果条件允许，最好设置一个洗涤室。室内应配备加热器、蒸锅、盆、桶等。用于洗涤器，还应配备各种瓶刷、去污粉、肥皂、洗衣粉等。
(三)灭菌室灭菌室主要用于培养基灭菌和各种器具灭菌，室内应配备高压蒸汽灭菌器、烘箱等灭菌设备和设施。
(四)无菌室无菌室，又称接种室，是系统接种、纯化菌种等无菌操作的专用实验室。菌种接种移植是微生物工作中的主要操作，其特点是保证菌种纯种，防止杂菌污染。在一般环境下的空气中，由于灰尘和杂菌较多，容易造成污染，对接种工作造成很大干扰。
